Kaip greitai koronavirusas gali mutuoti?

Naujasis koronavirusas, kaip ir visi kiti virusai, mutuoja arba patiria nedidelius jo genomo pokyčius. Neseniai paskelbtame tyrime teigiama, kad naujasis koronavirusas SARS-CoV-2 jau mutavo į dar vieną ir dar mažiau agresyvų kamieną. Tačiau ekspertai nėra įsitikinę.

70% viruso mėginių tyrėjai nustatė „L“ tipą, kuris, jų manymu, yra agresyvesnis. Jie taip pat nustatė, kad šio kamieno paplitimas sumažėjo po sausio mėnesio pradžios. Šiandien dažniausiai aptinkamas senesnis, „S“ tipas, nes „žmogaus įsikišimas“, pavyzdžiui, karantinai, galėjo sumažinti „L“ tipo galimybes plisti, rašė tyrėjai.

Tačiau Jelemo visuomenės sveikatos mokyklos epidemiologas Nathanas Grubaugh'as, kuris nebuvo tyrimo dalis, teigė, kad autorių išvados yra „gryna spekuliacija“. Visų pirma, pasak jo, mutacijų, į kurias nurodė tyrimo autoriai, buvo neįtikėtinai nedaug - pasak jo, pora nukleotidų - pagrindiniai genų blokai. (SARS-CoV-2 yra apie 30000 nukleotidų ilgio).

Tikėtina, kad šie nedideli pokyčiai neturės jokio didelio poveikio viruso veikimui, jei jo apskritai nebus, todėl būtų „netikslu“ sakyti, kad šie skirtumai reiškia, kad yra skirtingų padermių, sakė jis. Be to, tyrėjai nagrinėjo tik 103 atvejus. „Tai labai mažas visų virusų populiacijos pavyzdžių rinkinys“, - „Live Science“ pasakojo Grubaugh. Norėdami išsiaiškinti, ar visame pasaulyje virusas mutavo, reikia „nereikšmingų pastangų ir kartais prireikia daugelio metų“.

Kiti mokslininkai sutinka. Išvada, kad koronavirusas mutuoja į dvi padermes su L paderme, sukeliančia sunkesnę ligą, „greičiausiai yra statistinis artefaktas“, - „Twitter“ parašė Richardas Neheris, Šveicarijos Bazelio universiteto biologas ir fizikas. Šį statistinį poveikį tikriausiai lemia ankstyvas L grupės Wuhan mieste mėginių ėmimas, dėl kurio mirštamumas yra „didesnis akivaizdus“, rašė jis.

Sparčiai populiarėjant vietiniam protrūkiui, mokslininkai iš pacientų greitai imasi viruso genomų, todėl kai kurie viruso variantai buvo per daug reprezentuojami, rašė Neheris. Straipsnio autoriai pripažįsta, kad jų tyrimo duomenys yra „vis dar labai riboti“ ir jie turi sekti didesnius duomenų rinkinius, kad geriau suprastų, kaip virusas vystosi, rašė jie.

"Mes neturėtume jaudintis"

Žinodamas, kad tokio protrūkio metu pasirodys tokie dokumentai, Grubaugh paskelbė komentarą žurnale „Nature Microbiology“, vasario 18 d., Pavadinimu „Mes neturėtume nerimauti, kai virusas mutuoja ligos protrūkių metu“.

Žodžio mutacija „natūraliai perteikia baimę dėl netikėtų ir keistų pokyčių“, - rašė jis. "Iš tikrųjų mutacijos yra natūrali viruso gyvenimo ciklo dalis ir retai paveikia protrūkius." RNR virusai arba tie, kurių pagrindinė genetinė medžiaga yra RNR, o ne DNR, įskaitant SARS-CoV-2, nuolat mutuoja ir neturi tokių „klaidų“ taisymo mechanizmų, kaip, pavyzdžiui, daro žmogaus ląstelės.

Tačiau dauguma šių mutacijų neigiamai veikia virusą. Jei mutacijos nėra naudingos virusui, jos paprastai pašalinamos natūralios atrankos būdu, tai evoliucijos mechanizmas, kuriuo organizmai, geriau prisitaikantys prie savo aplinkos, linkę išgyventi. Kitos mutacijos išgyvena ir įsitvirtina „vidutiniame“ viruso genome.

Paprastai keli genai koduoja tokius požymius kaip viruso sunkumas ar galimybė perduoti kitiems žmonėms, rašė Grubaugh. Taigi, jei virusas tampa sunkesnis ar lengviau perduodamas, keli genai turėtų mutuoti. Nepaisant aukšto virusų mutacijos lygio apskritai, neįprasta rasti virusų, kurie per trumpą laiką keičia jų perdavimo būdą tarp žmonių, rašė jis.

Taigi, ką visa tai reiškia galimos vakcinos sukūrimui?

Šie virusai "vis dar yra genetiškai panašūs, kad šios mutacijos neturėtų pakeisti naujos vakcinos", - teigė Grubaugh. „Vargu, ar kūrėjai turi dėl to jaudintis“. Tačiau, pasibaigus vakcinai, virusas galėtų prie jo prisitaikyti ir atsirasti atsparumas, - sakė jis, tačiau atsižvelgiant į tai, kad kiti RNR virusai - tokie, kurie sukelia tymus, kiaulytę ir geltonąją karštligę - nesukūrė atsparumo vakcinoms, toks scenarijus mažai tikėtina.

Tiesą sakant, šios mutacijos padeda mokslininkams atsekti viruso pakopas.

Pavyzdžiui, grupė tyrėjų Brazilijoje neseniai išskyrė SARS-CoV-2 iš dviejų pacientų, kuriems buvo nustatytas COVID-19, ir nustatė visus viruso mėginių genomus. Jie nustatė, kad ne tik genomai skyrėsi vienas nuo kito, bet ir labai skyrėsi nuo viruso mėginių, surinktų Uhane, Kinijoje, genomų, tyrėjai rašė ataskaitoje, kuri nebuvo recenzuojama, bet paskelbta forume. vasario 28 d.

Iš vieno paciento Brazilijoje paimto koronaviruso genomas buvo panašus į Vokietijoje nustatyto viruso genomą, o antrojo paciento virusas panašus į koronaviruso Jungtinėje Karalystėje virusą. Tai reiškia, kad šie du pacientai yra susiję su atvejais Europoje, bet nėra susiję vienas su kitu, sakė Grubaugh.